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子宫动脉栓塞术虽然是一种创伤小、无失血、恢复快的新技术，但术后可引起发热、疼痛、盆腔感染、栓塞正常脏器、影响性功能等并发症；同时有X线的辐射影响。UAE治疗后2年内子宫肌瘤复发率为10%。
主要有如下副反应和并发症：
（1）栓塞剂的反流、导管移位、误栓、附壁血栓形成和肺栓塞。约5-43%的患者出现卵巢衰竭。
（2）盆腔疼痛：疼痛通常出现在术后6~8小时内，可持续几天。约有5~10%的妇女盆腔疼痛可持续至2周以上；如疼痛持续2~3个月以上，需手术治疗。
（3）栓塞后综合症：发生率为100%，约40%出现栓塞后综合症加重，包括下腹疼痛、发热、不规则阴道出血或阴道分泌物增多及恶心、呕吐。为自限性，通常经保守和支持治疗可在48小时-2周内自行缓解，偶尔可持续数月。
